Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tgm5Q9D7I9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms