Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cldn23Q9D7D7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cldn23Q9D7D7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms