Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb4aQ9D6F9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms