Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms