Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syce1Q9D495 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms