Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pus10Q9D3U0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms