Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ToporslQ9D2F8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ToporslQ9D2F8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms