Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Trappc6bQ9D289 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trappc6bQ9D289 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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