Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmbr1lQ9D1E5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms