Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms