Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms