Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rrs1Q9CYH6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrs1Q9CYH6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms