Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms