Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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