Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rpl11Q9CXW4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms