Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sgo1Q9CXH7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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