Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ddx47Q9CWX9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms