Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms