Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ddx28Q9CWT6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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