Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Msmo1Q9CRA4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms