Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atg12Q9CQY1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms