Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Atp5f1Q9CQQ7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp5f1Q9CQQ7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms