Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms