Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Atp6v0e1Q9CQD8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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