Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sar1bQ9CQC9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms