Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpa3Q9CQ71 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpa3Q9CQ71 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms