Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms