Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Krt88Q9CPR6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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