Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms