Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hdac9Q99N13 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hdac9Q99N13 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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