Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PtprtQ99M80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PtprtQ99M80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PtprtQ99M80 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PtprtQ99M80 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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PtprtQ99M80 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprtQ99M80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtprtQ99M80 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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