Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rcbtb2Q99LJ7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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