Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gps1Q99LD4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gps1Q99LD4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms