Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pagr1aQ99L02 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms