Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rab28Q99KL7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab28Q99KL7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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