Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms