Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Higd1bQ99JY6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Higd1bQ99JY6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms