Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TrabdQ99JY4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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