Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TirapQ99JY1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms