Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxp3Q99JB6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxp3Q99JB6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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