Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apobec3Q99J72 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms