Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ttc30a1Q99J38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc30a1Q99J38 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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