Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Csmd1Q923L3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms