Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clip1Q922J3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip1Q922J3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms