Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Afg3l1Q920A7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms