Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1bQ91YK2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms