Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pcdhb12Q91Y07 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pcdhb12Q91Y07 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms