Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm4sf4Q91XD3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms