Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dkk4Q8VEJ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dkk4Q8VEJ3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms