Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms